尼康D600作为入门级全幅单反，较D800在对焦系统方面有所缩水，其采用了与D7000类似的39点自动对焦系统，而不是D800的51点自动对焦系统。
2016像素RGB传感器提高了场景识别系统的准确度
不同自动对焦点对焦示意图
具体来讲，D600采用了一块Multi-CAM 4800对焦模块。具有39个焦点精确捕捉和追踪主体。9个十字型对焦点覆盖最常使用的中心区域，f/8 时中央7个对焦点可用（中央5个，中线左右各1个）。使用1.4 倍或1.7倍增距镜时也可以进行自动对焦。当使用2倍增距镜配合f/4最大光圈的远摄镜头时，即使光圈为f/8时也能实现精确自动对焦。
D80051点自动对焦系统示意图
而D800的51点自动对焦系统，同D4相同，所以在对焦系统上，D800相比较D600具有一定的优势。
